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제주도는 난대, 온대, 한대식물이 고루 분포해 1,795종의 풍부한 자생식물을 자랑한다. 한라산의 다양한 고도에 따라 제주만의 특산 및 희귀식물이 자라며, 왕벚나무가 자생했던 한라산은 유일한 자생지로 알려져 있었다.

독도에서 새로운 생물종이 발견되었다. 식물 5종, 곤충 2종, 버섯 1종이며, 지금까지 독도에서 발견된 생물종은 640종이다. 독도는 가치있는 메탄 하이드레이트 천연자원도 보유하고 있어 관심을 받고 있다.

갈라파고스 제도는 찰스 다윈의 '종의 기원'으로 유명해진 생물의 낙원이다. 다양한 동식물이 서식하며, 자연 보호가 잘 이루어지고 있다. 여행은 유람선을 통한 패키지로 제한되며, 희귀 종 관람과 함께 태고의 자연을 감상할 수 있다.