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오명 과학기술부 장관이 과학기술 부총리로 승격되었으며, 행정부 내 서열이 3위로 상승했다. 또한, 과학기술혁신본부 신설 및 과학기술위원회 기능 강화 등 과학기술행정체제가 개편되었다.

...격상하고 과학기술 정책 총체적 관리를 강화할 계획을 밝혔다. 오명 신임 장관은 국가 과학기술정책의 지주회사적 역할을 강조하였고, 과기부, 산자부, 정통부 장관은 협력을 약속했다. 그러나 부총리 제도의 법적 확립에 시간이 걸릴 수 있으며 기초과학의 소외 우려도 제기되었다.

노무현 대통령 주재 국정과제회의에서 과학기술부 장관을 부총리로 승격하고 R&D 기획 관리 업무를 과학기술부로 일원화하기로 결정. 관련 부처간 중복 및 갈등 해소 예상되며, 과학기술부는 개방형 조직으로 전환.