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에볼라와 에이즈는 모두 아프리카에서 발생하고 체액 접촉으로 감염되는 공통점이 있으나 다른 바이러스로 인해 발생하며 임상 양상과 전파 방식에 차이가 있다. 에볼라는 매우 짧은 잠복기 후 급속히 증상이 나타나며, 에이즈는 장기간 동안 다양한 증상이 점진적으로 나타난다.

에볼라 바이러스는 혈액, 체액 접촉을 통해 전염되며, 출혈과 내부 장기 손상을 일으킨다. 이 바이러스의 치사율은 최대 90%에 달할 수 있다.